收拾好对生死不明的同伴的担心，草帽海贼团的十名成员和沉寂已久的sunny号终于再度踏上了他们的冒险旅程。
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就在草帽海贼团和人鱼岛上和发动政变妄想要统治全世界人类的鱼人们陷入苦战的时候，位于新世界的庞克哈萨德岛屿正悄然发生着变化。
庞克哈萨德这座岛屿面积并不大，但是这片大的岛屿上所经历过的事情以及现状都让人毛骨悚然。庞克哈萨德曾经是海军的研究基地，并收押着一些世界政府的犯人，四年前因为凯撒的实验，大量毒气将整个岛屿笼罩起来，整个岛屿变成了一座死岛。在岛上侥幸存活下来的少许犯人，也因为中毒，下肢失去了知觉。
两年前，这个岛屿的剧毒物质逐渐消散，就在这座岛屿即将恢复生机的时候，又经历了一次严重的创伤。顶上战争最终非但没能杀死处刑犯艾斯，还让海军本部马林福特岛屿几乎全毁，顶上战争的失败需要有人来承担责任，一手策划顶上战争的海军战国元帅引咎辞职。为了选举新任元帅，海军本部大将赤犬与青雉选择了在庞克哈萨德决出胜负，胜者将会成为元帅。两人大战十天十夜，最后赤犬胜出。冰与岩浆果实能力者的对决，导致庞克哈萨德气候大变，变成了冰火两重天的岛屿。
这座已经彻底失去生机的岛屿并没有就此荒废，一股神秘势力继续在庞克哈萨德的冰半岛上的研究基地里活动，用这里的生化研究设备进行许多神秘的研究。这个神秘势力的boss是那个在四年前让庞克哈萨德变成死岛的凯撒，以这个男人的残忍程度，他瞒着海军偷偷摸摸进行的研究怎么想都不会是好东西。
顶上战争让海军势力大洗牌的同时，海军手下的海贼七武海也进行了大洗牌，和路飞同为超新星海贼的罗用一百颗海贼的心脏换来了七武海的位置。但这个合法海贼却并没有在新世界大展身手，而是蜗居在小小的庞克哈萨德岛屿上充当看门狗，他自己的心脏也被凯撒牢牢地握在手心。
这个给人感觉总是在算计着什么的高瘦男人，此时正面临着一个麻烦，这个麻烦是一个外来的入侵者，他到底是用什么方法来到这座岛屿的，又是怎么。
作者有话要说：昨天写太晚了，忘记告诉你们，鉴于很多妹子都想看，所以回馈读者的无责任番外会有郑希的清水番外